食品經營許可證和餐飲衛生許可證的申請有以下區別：

申請目的不同：食品經營許可證是用于食品生產和流通企業的經營許可證，而餐飲衛生許可證是用于規范餐飲企業的衛生許可證。

申請條件不同：食品經營許可證的申請條件包括具有與經營的食品品種、數量相適應的經營設備或者設施、有相應的消毒、更衣、洗滌、照明、通風、防腐、防塵、防蠅、防鼠、防蟲、洗滌、廢水處理和垃圾、廢棄物存放的設備或者設施等。而餐飲衛生許可證的申請條件包括具有合理的設備布局和工藝流程，防止待加工食品與直接進口的食品、原料和成品交叉污染，避免食品接觸有毒、不潔物質等。

申請流程不同：食品經營許可證的申請流程包括填寫食品經營許可證申請表、準備公司身份證、員工身份證、健康證的復印件等材料，而餐飲衛生許可證的申請流程可以參考食品經營許可證的申請流程，具體可以咨詢當地衛生部門或相關機構。

證書有效期不同：食品經營許可證的有效期為5年，而餐飲衛生許可證的有效期一般是2年，到期需要更換。

需要注意的是，以上僅是簡要區別，具體區別還需要根據不同地區和不同類型的許可證辦理要求進行比較。無論是食品經營許可證還是餐飲衛生許可證，都是規范食品生產和經營的重要證件，需要認真辦理。