醫用內窺鏡清洗消毒設備的注冊證辦理，需要按照國家相關法規和標準進行申請。以下是辦理注冊證的一般流程：

確定產品分類：醫用內窺鏡清洗消毒設備通常屬于第二類醫療器械，需要辦理醫療器械注冊證等審批手續方可上市銷售。

準備申請資料：收集和整理醫用內窺鏡清洗消毒設備的技術資料、生產工藝、質量標準等相關資料，確保資料完整、準確。這些資料通常包括產品說明書、技術規格、生產工藝、質量管理體系文件、產品檢測報告等。

提交申請：將申請資料提交給國家藥品監督管理部門或者指定的醫療器械注冊受理機構。

受理審查：注冊受理機構對申請資料進行受理審查，確認資料是否符合要求。

技術審查與批準：如果申請資料符合要求，注冊受理機構將對醫用內窺鏡清洗消毒設備的安全性、有效性、質量可控性等方面進行審查和評估，并作出是否批準的決定。在這個過程中，可能需要配合監管部門的調查和檢查，包括提供相關文件、樣品和人員培訓等。

獲得字號或許可證：如果申請符合所有要求，監管機構將核準醫用內窺鏡清洗消毒設備，并頒發相應的字號或許可證，以證明該產品符合相關法規和標準的要求。

市場上市：獲得字號或許可證后，企業可以在所在國家或地區合法銷售醫用內窺鏡清洗消毒設備。